马来西亚中医师针灸专业学会的宗旨是发扬针灸学术、维护中医声誉，以及促进国际针灸学术交流。 1997年，针灸专业学会与中国天津中医药大学联办中医硕士、博士研究生课程。又于2005年与中国天津中医药大学联办本、硕连读课程班，当时学员有21位。至目前已培训了33 位硕士毕业生、3位博士毕业生，考获研究生毕业证书及受中国国家教育委员会颁发学位证书。目前在籍硕士研究生有5位，攻读博士研究生5位。
2006年4月22至23日，由世界针灸学会联合会主办、本学会承办的“世界针灸学会联合会马来西亚2006国际针灸学术研讨会” ，在吉隆坡会议展览中心(KLCC)成功举行，出席人数达一千余人。此外，为了提高同业对中医学术与对疾病治疗水平，本会每年举办不同课题的培训课程，提供会员有关最新医疗的资讯及学习平台。
本学会近期举办的课程培训班包括了：中华针刀传承脉络第一代传承人—周中焕教授主讲的《针刀调整腰腿痛疾病（高级班）》培训课程、马来西亚中医总会荣誉顾问—谢奇医师主讲的《眼科深针疗法传承班》及上海中医药大学附属市中医医院眼科主任—朱莺教授主讲的《眼科专业培训班》等。
本学会不定期的在各地郊区举办慈善义诊活动，不分种族，免费提供中医针灸治疗服务，深受各界病者的好评。